故事的時空被設置在公元前1100年左右，也即是中國商朝末年紂王統治的年期。一直以來仙人界與人間界均相安無事，甚少互相干預。但自從仙人界的妲己下降到人間界並憑藉其妖術魅惑紂王，導致民不聊生，三大仙人便決定插手干預整個情況。由崑崙山元始天尊派遣其大弟子太公望(呂望)執行封神計劃。
封神計劃的原意是把在人間界搗亂的仙人趕離人間界，而封印在一個新的世界─神界當中。當太公望把這些仙人消滅後，他們的魂魄就會飛到一個臨時的空間──封神台中。但當太公望一直執行着封神計劃時，卻發覺名單上有許多未有干預人間界的仙人，當中包括他多名的同袍──崑崙山的十二仙等。直到故事末段太公望才完全發現封神計劃的真實目的。
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