1954年 哥斯拉 Poster
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漁船「栄光丸」因不明原因發生了沉沒事故。甚至連前往救助的貨輪「備後丸」與大戶島（通常讀音作「おおとじま」，但在本片中則是發音為「おおどしま」）的其他漁船都陸續遇難沉沒。根據生還船員的證詞，船隻是遭到了怪物的襲擊。聽到此事的島上老人，道出此事乃大戶島上傳說中的怪物「哥斯拉」（ゴジラ）所為。
就在一個暴風雨之夜，島上出現了一頭巨大生物登陸，破壞了房屋並造成死傷。因此，生物學家山根恭平博士組成了調査團前往調查。而他的女兒恵美子，與她的男友南海打撈所長尾形秀人也一同前往大戶島，他們也目擊了這頭巨大生物。博士將這巨大生物視為「可能是潛藏海底洞窟的太古生物，因氫彈試爆而出現」，並在國會中提出報告。博士根據島上的傳說，決定將此生物稱作「哥斯拉」。政府開始對哥吉拉在大戶島西海岸的海上，以巡防艦進行水雷攻撃。在電視上得知此事的山根博士，基於生物學家的立場上，對政府決定消滅哥吉拉的方針深感痛心。另一方面，恵美子前往造訪科學家芹澤大助博士（也是她的前未婚夫），在他的研究所中發現芹澤正在進行一項極機密的實驗，因此芹澤要求她絕對要守口如瓶。
當晚，哥斯拉於東京登陸。在破壞城市與列車後入海而去。防衛隊以五萬伏特電流的高壓送電線式鐵條網，在東京灣沿岸散佈，企圖阻止哥斯拉登陸，但哥斯拉卻突破高壓電與防衛隊的攻撃再度登陸東京。牠將電視天線塔打斷，毀掉大樓與國會議事堂，口中並噴出白熱光，將市區化為一片火海。
恵美子為災民進行救護，但在看到人們的慘狀下再也無法忍受，對尾形說出了芹澤的秘密：她在芹澤的研究所中所見到的，是可將水中的氧氣在瞬間破壞，讓所有生物滅絕的「氧氣破壞裝置」（オキシジェン・デストロイヤー）。尾形帶著恵美子尋訪芹澤，請求他動用氧氣破壞裝置，但芹澤卻以「氧氣破壞裝置會成為可怕的武器，將它公諸於世，恐怕會遭到軍事運用」的理由而堅拒。但在看到電視上哥吉拉造成的災情後，也使芹澤暗自下定了某種決心，結果他答應只能使用一次。
與尾形一同潛水進入東京灣的芹澤，將氧氣破壞裝置啟動，終於使哥吉拉化為白骨葬身海底，但芹澤卻擔憂氧氣破壞裝置遭到惡用，自行切斷安全繩與氧氣破壞裝置一起毀滅。在人們終於打倒哥吉拉的喜悅與哀悼芹澤之死的悲痛兩相交織之中，山根博士卻獨自低語著：「我不認為那隻哥斯拉會是最後一隻。如果再繼續進行氫彈試爆，那隻哥斯拉吉拉的同類也許還會在世界某處出現……」
