不遠的未來，一群變種的海洋生物與人類展開對抗，導致海平面上升，淹沒了許多陸地。人類為了奪回賴以生存的土地，深入海洋尋找怪物巢穴，而“青之６號”就是人類寄予最後希望的一艘威力強大的潛水艇。
科學怪人約翰·達古一心要毀滅人類，他造成了冰川融化、海水淹沒大地、10億人喪生的慘劇還不罷休，還試圖引發兩極置換、破壞地球電磁場、以致徹底毀滅人類的所謂P OLE SHIFT 。各國聯合艦隊為了奪回賴以生存的土地，決定深入海洋，向約翰·達古的南極基地發起核攻勢。而青之六號就是聯合艦隊中人類寄予最後希望的一艘威力強大的潛水艇，在這場大戰中發揮了舉足輕重的作用。
《青之六號》的原作是60年代一部以科幻題材出名的日本少年漫畫作品。不過，這次我們要介紹的卻不是這部漫畫作品本身，而是作為動畫改編版，於1998年推出的4集OVA動畫——《青之六號》。這個動畫版的特別之處就在於，其異常出色的3D畫面效果，開創了日本二維動畫和三維動畫結合應用的新的廣闊天地。
