故事講述過去曾經在小學組成游泳同好會的七瀬遙、橘真琴、松岡凛、葉月渚，在小學最後的大會獲勝後便各奔東西。在大家進入高中之後，某日凛突然現身在已經是普通高中生的遙面前，表示要一較泳技高下，看見泳技如此精進的凜，遙也湧起了競爭意識，於是召集起過去的同伴真琴、渚還有新成員龍之崎怜一同成立了岩鳶高中游泳社……。
1Fr 重逢於起跳台
遙和真琴在升上新學年，在岩鳶高中重遇兒時一起游泳的好友渚。三人聽說兒時常去的游泳俱樂部要倒閉，便再到俱樂部找回從前埋下的時間囊，沒想到在那兒重遇凜。凜的性格跟從前大大改變，一見面便要求跟遙比賽。
真琴跟渚在學校裏找到了凜的妹妹江，江很擔心哥哥的情況，並告知二人凜在鮫柄學園就讀。二人帶著遙潛入鮫柄學園，終於再跟凜重逢。
2Fr 追憶的距離
遙、凜在鮫柄學園進行比賽，惜賽後被老師發現，眾人無法了解凜的近況。渚提議成立游泳學會，以求在比賽中重遇阿凜。小天老師成功向學校申請成立學會，但要求要找到四位成員及打理好泳池。
真琴在俱樂部重遇笹部教練，終於發現原來遙在中一時曾與凜見面並打敗凜，此事可能是令凜陷入低潮，而遙則放棄競泳的原因。
3Fr 海豚式打水的理論
天方老師指出雖成立了游泳學會，但學會選手最好有四人，遙等人逐開始找尋新會員。渚發現同學怜跟他們有著名字上的共通點，希望怜能加入學會，理由是游泳不符合他的美學，但最後他亦答應出席跟鮫柄的聯校訓練。
三人在聯校訓練時才發現原來怜一直不肯下水的原因是他根本不會游泳！但看遙的泳姿深深打動了怜，讓他下定決心在游泳中追求真正的Free。
4Fr 被囚禁的蝴蝶
集齊了四位會員，岩鳶的游泳學會正式開始訓練。但首要的事項是讓阿怜學會游泳。但是即使經過阿渚和真琴的指導，阿怜也未能順利在水中暢泳。於是，阿怜把問題歸咎於泳褲上。眾人逐去買新泳褲。
阿遙在商舖中巧遇阿凜。阿凜質疑阿遙上次決鬥放水，要求重賽，二人約定於縣大賽再次認真比賽。至於仍未能順利游泳而受挫的阿怜，在誤打誤撞下學會了蝶式，終於能參與大家的訓練。
5Fr 開放水域的考驗
小江在休息室找到一張從前在游泳學會留下來的集訓計劃，激發起眾人前往集訓的興趣，但被小天老師一句「沒有經費」而擊沉了。真琴不想大家失望，於是想出不用也能去的方法。
阿憐無法追上大家在無人島訓練的進度，心中非常內咎，逐在晚上趁大家睡著的時候落海練習，豈料突然刮起暴風雨。阿憐的身影消失於海中…
6Fr 衝擊的屏息衝刺
怜在深夜游泳遇溺，連帶真琴也出了意外。遙及渚發現二人不見後，馬上出外救人。幾經辛苦，阿遙終於成功把真琴救上島上休息。遙察覺真琴臉色有異，他仍未克服心理陰影。之後，四人找到一間餐館避雨同過夜，渚提出一起玩遊戲，其實是想令因救不到怜而悶悶不樂的真琴打氣。怜忍不住詢問有關真琴為何對海有恐懼感。事緣有一位漁夫跟真琴非常友好，他於大海中過世有關。幸好真琴的身邊有遙陪伴著，終令他克服了恐懼。
7Fr 決戰的拿手泳式
縣大會到來了，游泳部的大家也非常努力。可是凜卻夢見悲傷往事，從夢中驚醒。原來凜的父親在他很小的時候就被大海奪去了生命，凜為完成父親的遺願而努力游泳。凜與遙終於在大會上一決勝負，結果卻令眾人意外，遙輸給了凜！戰勝了遙的凜歡喜若狂，並對遙說：「遙，我贏了，以後我們不會再有機會一起游泳了，永遠不會。」被打擊的遙看著凜離去的背影，心情非常低落...
8Fr 反擊之混合接力
跟凜比賽後輸了的遙心情極為低落，相反凜則相當愉快。擔心遙的怜他們在找尋遙的途上遇上凜，更加確定了遙並非為勝負一事而失落。及後，三人雖然在比賽中落敗，但看著他們比賽的遙卻被打動了。
江暪著眾人擅自報名參加混接，眾人擔心遙不欲參加，但聽完各人的電話留言後，遙決定為他們再一次投入比賽當中。
9Fr 迷茫的喘息空間
在遙的努力追趕下，岩鳶游泳學會終於成功出線。遙在各隊員的歡迎聲中，似乎發現了比游水的目的更重要的事情。看到岩鳶成功出線的凜，心中越發煩燥。鮫柄為了祈求於地區大賽取勝，而岩鳶則為了讓遙打起精神，兩隊人馬不約而同地一同參加神社舉辦的祭典。凜重遊舊地，決定代表鮫柄參加接力，再次與遙一決高下。
10Fr 焦躁的心率
各人一直討論能與凜再次比賽而興奮不已，怜為此感到不滿，認為他們是代表學校，而非代表個人而比賽。笹部答應成為他們的教練並努力訓練他們，怜發現遙漸漸失去從前自由的感覺。遙決定對他們說出從前的事，並表示自己也不知道為何自己如此執著於凜的挑戰。怜聽了兩人從前的事後，決定直接前往鮫柄與凜商量。
11Fr 激情的All
Out
為了打探凜的真意，怜獨自前往鮫柄質問他。兩人吵起來不歡而散。真遙到怜家探病的時候得知怜是去找凜。遙道出自己希望跟現在的同伴一起游水，怜感到很高興。
四人為了比賽先行到達比賽地區留宿，而鮫柄也是一樣。被怜的質問打亂了練習的凜，深夜約怜出來，道出自己一直以來的秘密。互相鼓勵後，凜回到酒店卻被通知從出賽名單中除下的消息。
12Fr 遙遠的自由
受到重大打擊的凜無法振作，在自己的項目中完全沒有發揮出水準而敗陣。似鳥欲上前安慰，卻被拒絕，凜揚言自己以後放棄游泳。遙聽到後再次被打擊，一厥不振。怜不欲就此敗陣，提出由凜出賽的建議。
凜其實內心極想跟遙一起游泳，但無耐卻無法坦誠面對幼稚的想法。放下一切後，凜跟昔日旳同伴再次出戰接力，重新燃起對游泳的熱情。
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