一卷神秘的錄影帶，千年神器中千年眼的擁有者，貝卡斯在錄影帶中使用黑暗決鬥向武藤遊戲挑戰，但遊戲卻為時間終止而敗北，武藤雙六的靈魂也因此被千年眼的力量封印在靈魂封印卡中，武滕遊戲為了救回靈魂被囚禁的爺爺，前往決鬥者王國找貝卡斯決鬥，與互信的夥伴們以及心中的另一個自己並肩作戰，另外 海馬也向貝卡斯提出挑戰 但是海馬的力量打不過擁有千年眼的貝卡斯 因此也被貝卡斯的千年眼的力量封印在靈魂卡中 ......

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